Nivel 7 [Protocolo Omega] continúa justo donde lo dejó NIVEL 7 [ESCAPE]. Las instalaciones de Subterra Bravo se han sumido en el caos gracias a las acciones de los jugadores en [ESCAPE], y ahora el gobierno ha enviado una unidad de fuerzas especiales altamente entrenada y de alto secreto para cerrar las instalaciones y eliminar todo lo que queda en la base.
En [Protocolo Omega], un jugador asume el papel del Supervisor mientras que de dos a cinco jugadores más asumen el papel del equipo de élite de Operaciones Especiales. El papel del Supervisor en el juego es controlar todos los habitantes alienígenas y los desafíos a los que se enfrentan los jugadores a lo largo del juego. Los jugadores intentan alcanzar objetivos específicos basados en el escenario, explorando un mapa que se establece al principio y luchando contra las hordas de alienígenas que el Supervisor les envía.
Generan adrenalina para hacer cosas como moverse, atacar y realizar acciones especiales como activar un espacio objetivo. Esa generación también tiene un efecto negativo para ellos, ya que esa adrenalina se transfiere al jugador supervisor, que la utiliza para engendrar alienígenas, crear nuevas amenazas y perjudicar las posibilidades de éxito de los soldados durante el escenario. Cuantas más acciones realicen los jugadores de Operaciones Especiales, más recursos tendrá el jugador Supervisor para trabajar.
Los personajes de [Protocolo Omega] están representados por miniaturas, y cada personaje de Operaciones Especiales y de los alienígenas tiene diferentes atributos, poderes y habilidades y equipo personalizables
